Les documents sont conditionnés dans des chemises et boîtes en matériaux neutres (sans acide) et rangés dans des magasins de conservation climatisés, protégés contre l’incendie, et dont l’accès est réservé aux seuls archivistes.

Les documents détériorés par le temps ou les mauvaises conditions de conservation sont peu à peu confiés à des ateliers professionnels pour être restaurés ;

Terriers médiévaux des pays de l'Ain, itinéraire d'une restauration.

Le Département de l’Ain a engagé depuis 1999 une campagne de numérisation des archives les plus consultées ou les plus fragiles : registres paroissiaux et d’état civil, recensements de population, registres matricules du recensement militaire, plans cadastraux, fonds photographiques sur plaques de verre… sont consultables en version électronique et ainsi mis à l’abri des manipulations.

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